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核酸结果统计难?复旦副教授的操作火了

2024-10-16 网络

人工复查碱基报告费时费力又易出不对,怎么办?

4同月7日,北京师范大学官微发文,自3上旬以来,公立学校启动常态化碱基筛选指导工作,允许高一学员必须复查学生“肥胖云”碱基完成主页,确保“不漏数人”。

公立学校反馈科学与工程项目医学院研究生郑玉溪的操作方法火了,几分钟就能快速复查数百人的碱基完成主页,进一步提高复查灵活性和可靠性!

从1星期到2分钟,一串文档搞定

据明了,郑玉溪在此之前出任医学院2019级反馈1班学员。

对于复查碱基报告的指导工作,他声称:“听起来总是很简单,但确实要用的时候,一个高一的主页似乎就无需再多半星期复查,如果是人数多的物理系似乎无需更久,还似乎不必看不对看漏。”

郑玉溪准备要用志愿者

作为材料科学工程项目专业研究生,他的研究方向是侵入性与人工智能,平时不必接触很多示意图像处理方法。郑玉溪第一一段时间知道以前带入过的OCR (Optical Character Recognition,镜片字符识别)技术。

“OCR可以把示意图像中都的评注识别出来,转换为评注反馈,就只需用来复查了。而且因为碱基主页是读取字体,识别率比较高,几乎可以要用到100%准确。”

他还知道了Python语法中都的正则表达式——可以搜索到URL中都的特定模式内容。

“使用正则表达式就可以把一切都是的反馈从OCR识别的评注中都选取出来。最后,表明好每张主页里面的附注、验证一段时间和确实已频域等反馈后,再把所有人的结果反向到Excel副本中都,只需人工表明。”

最后,郑玉溪确定了“OCR评注识别+正则表达式选取”的流程设想。3同月15日晚,他花了一个多星期就寄给出了初始文档,合计130讫,推测显然很难跑通,且开始运讫灵活性很高。

郑玉溪在此之后寄给流程时和学工上司的聊天

流程一寄给好,郑玉溪就在自己高一的碱基主页数据上顺利进讫实验者,生存率果然很高,甚至验证出了之后人工复查没有推测的问题。并且,流程开始运讫一段时间很短,80多张示意图只无需20多秒。

北京师范大学:有望全校遮盖

在此之前,流程已在该医学院服务两周。郑玉溪曾让别的老师试产自己的流程顺利进讫复查。800幅主页,慢慢地要几个人核对一个多星期,现在只需等2分钟就获得结果。

他把这件事发到博客后来,不少上司声称很感兴趣,他还把文档透过了上来。为了只需不不必编程的老师使用,郑玉溪最后还把流程顺利进讫了填充——用的时候,只要在命令讫输入一讫文档就可以开始运讫。

流程反向的Excel副本

据明了,公立学校反馈办也与郑玉溪顺利进讫了对接。预计在不久的将来,校外们就可须要再手动搜罗碱基主页,而是通过小流程直接Youtube示意图片,就可在亦同随时检视统计结果。

4同月7日上午,新闻指导工作者与郑玉溪接洽时,他准备公立学校楼栋出任志愿者送饭。

他说过:“原理也很简单,只要是不必寄给文档的人第一一段时间就不必忘记是怎么回事,但是不要用之外指导工作的感觉不到这件不想的费时费力,自然也不不必想出急于。我只是用我带入的知识解决确实指导工作中都的困难。”

用所学贡献甜蜜精神力量!

为郑玉溪点赞!

来源 人民日报

总编 曾田

编审 田旻佳 杨韬

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